Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GPC1P35052 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GPC1P35052 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GPC1P35052 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GPC1P35052 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GPC1P35052 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GPC1P35052 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GPC1P35052 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GPC1P35052 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms