Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD1P28340 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD1P28340 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD1P28340 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD1P28340 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD1P28340 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD1P28340 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD1P28340 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD1P28340 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD1P28340 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD1P28340 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD1P28340 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD1P28340 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD1P28340 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD1P28340 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD1P28340 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD1P28340 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLD1P28340 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD1P28340 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD1P28340 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD1P28340 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD1P28340 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD1P28340 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD1P28340 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD1P28340 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD1P28340 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD1P28340 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD1P28340 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD1P28340 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD1P28340 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD1P28340 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD1P28340 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD1P28340 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD1P28340 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD1P28340 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD1P28340 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLD1P28340 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLD1P28340 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD1P28340 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD1P28340 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD1P28340 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD1P28340 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD1P28340 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD1P28340 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD1P28340 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD1P28340 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD1P28340 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD1P28340 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD1P28340 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD1P28340 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD1P28340 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD1P28340 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLD1P28340 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms