Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4AP27815 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE4AP27815 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms