Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GABRR1P24046 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GABRR1P24046 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms