Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF3P18847 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF3P18847 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF3P18847 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF3P18847 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF3P18847 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF3P18847 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF3P18847 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF3P18847 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF3P18847 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF3P18847 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF3P18847 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF3P18847 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF3P18847 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF3P18847 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF3P18847 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF3P18847 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF3P18847 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF3P18847 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF3P18847 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF3P18847 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF3P18847 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF3P18847 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF3P18847 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF3P18847 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF3P18847 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF3P18847 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF3P18847 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF3P18847 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF3P18847 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF3P18847 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF3P18847 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF3P18847 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF3P18847 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF3P18847 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF3P18847 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF3P18847 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF3P18847 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF3P18847 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF3P18847 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF3P18847 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF3P18847 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF3P18847 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF3P18847 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF3P18847 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF3P18847 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF3P18847 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF3P18847 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF3P18847 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF3P18847 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF3P18847 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF3P18847 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF3P18847 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF3P18847 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF3P18847 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF3P18847 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF3P18847 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF3P18847 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF3P18847 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATF3P18847 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATF3P18847 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATF3P18847 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATF3P18847 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF3P18847 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF3P18847 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF3P18847 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF3P18847 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF3P18847 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF3P18847 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF3P18847 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF3P18847 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF3P18847 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF3P18847 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF3P18847 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF3P18847 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF3P18847 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF3P18847 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF3P18847 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF3P18847 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF3P18847 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF3P18847 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF3P18847 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF3P18847 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF3P18847 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF3P18847 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF3P18847 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF3P18847 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF3P18847 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF3P18847 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF3P18847 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF3P18847 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF3P18847 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF3P18847 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms