Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTMAP06454 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTMAP06454 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTMAP06454 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTMAP06454 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTMAP06454 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTMAP06454 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTMAP06454 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTMAP06454 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTMAP06454 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTMAP06454 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTMAP06454 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTMAP06454 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTMAP06454 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTMAP06454 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTMAP06454 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTMAP06454 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PTMAP06454 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTMAP06454 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTMAP06454 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTMAP06454 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTMAP06454 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTMAP06454 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTMAP06454 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTMAP06454 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTMAP06454 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTMAP06454 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTMAP06454 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTMAP06454 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTMAP06454 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTMAP06454 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTMAP06454 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTMAP06454 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTMAP06454 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTMAP06454 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTMAP06454 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTMAP06454 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTMAP06454 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTMAP06454 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTMAP06454 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTMAP06454 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTMAP06454 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTMAP06454 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTMAP06454 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms