Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP9O75884 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms