Protein–RNA interactions for Protein: A3KN83

SBNO1, Protein strawberry notch homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1A3KN83 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SBNO1A3KN83 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SBNO1A3KN83 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBNO1A3KN83 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBNO1A3KN83 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SBNO1A3KN83 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBNO1A3KN83 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SBNO1A3KN83 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SBNO1A3KN83 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SBNO1A3KN83 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SBNO1A3KN83 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SBNO1A3KN83 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SBNO1A3KN83 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SBNO1A3KN83 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms