Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT03

TRAV26-1, T-cell receptor alpha variable 26-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV26-1A0A087WT03 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV26-1A0A087WT03 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV26-1A0A087WT03 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV26-1A0A087WT03 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV26-1A0A087WT03 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV26-1A0A087WT03 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV26-1A0A087WT03 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV26-1A0A087WT03 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV26-1A0A087WT03 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TRAV26-1A0A087WT03 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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TRAV26-1A0A087WT03 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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