Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU60

Atrn, Attractin, mousemouse

Predictions only

Length 1,428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrnQ9WU60 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AtrnQ9WU60 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
AtrnQ9WU60 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AtrnQ9WU60 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AtrnQ9WU60 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AtrnQ9WU60 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
AtrnQ9WU60 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AtrnQ9WU60 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
AtrnQ9WU60 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AtrnQ9WU60 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AtrnQ9WU60 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
AtrnQ9WU60 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AtrnQ9WU60 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AtrnQ9WU60 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AtrnQ9WU60 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
AtrnQ9WU60 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AtrnQ9WU60 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
AtrnQ9WU60 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AtrnQ9WU60 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AtrnQ9WU60 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
AtrnQ9WU60 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AtrnQ9WU60 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AtrnQ9WU60 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AtrnQ9WU60 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AtrnQ9WU60 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
AtrnQ9WU60 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AtrnQ9WU60 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
AtrnQ9WU60 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AtrnQ9WU60 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AtrnQ9WU60 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
AtrnQ9WU60 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AtrnQ9WU60 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AtrnQ9WU60 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AtrnQ9WU60 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AtrnQ9WU60 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AtrnQ9WU60 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AtrnQ9WU60 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
AtrnQ9WU60 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AtrnQ9WU60 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
AtrnQ9WU60 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
AtrnQ9WU60 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AtrnQ9WU60 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AtrnQ9WU60 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
AtrnQ9WU60 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
AtrnQ9WU60 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
AtrnQ9WU60 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
AtrnQ9WU60 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AtrnQ9WU60 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
AtrnQ9WU60 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AtrnQ9WU60 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AtrnQ9WU60 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AtrnQ9WU60 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
AtrnQ9WU60 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AtrnQ9WU60 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AtrnQ9WU60 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AtrnQ9WU60 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AtrnQ9WU60 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AtrnQ9WU60 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AtrnQ9WU60 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AtrnQ9WU60 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AtrnQ9WU60 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AtrnQ9WU60 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AtrnQ9WU60 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AtrnQ9WU60 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
AtrnQ9WU60 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
AtrnQ9WU60 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AtrnQ9WU60 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AtrnQ9WU60 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
AtrnQ9WU60 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AtrnQ9WU60 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AtrnQ9WU60 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AtrnQ9WU60 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AtrnQ9WU60 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AtrnQ9WU60 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AtrnQ9WU60 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AtrnQ9WU60 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AtrnQ9WU60 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AtrnQ9WU60 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AtrnQ9WU60 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AtrnQ9WU60 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AtrnQ9WU60 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
AtrnQ9WU60 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AtrnQ9WU60 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
AtrnQ9WU60 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AtrnQ9WU60 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
AtrnQ9WU60 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AtrnQ9WU60 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AtrnQ9WU60 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
AtrnQ9WU60 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
AtrnQ9WU60 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AtrnQ9WU60 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AtrnQ9WU60 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AtrnQ9WU60 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AtrnQ9WU60 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AtrnQ9WU60 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AtrnQ9WU60 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AtrnQ9WU60 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AtrnQ9WU60 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AtrnQ9WU60 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AtrnQ9WU60 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms