Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC7

Prkar1a, cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkar1aQ9DBC7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prkar1aQ9DBC7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prkar1aQ9DBC7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prkar1aQ9DBC7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prkar1aQ9DBC7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prkar1aQ9DBC7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Prkar1aQ9DBC7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Prkar1aQ9DBC7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkar1aQ9DBC7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkar1aQ9DBC7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Prkar1aQ9DBC7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkar1aQ9DBC7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkar1aQ9DBC7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkar1aQ9DBC7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkar1aQ9DBC7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkar1aQ9DBC7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkar1aQ9DBC7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkar1aQ9DBC7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkar1aQ9DBC7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prkar1aQ9DBC7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkar1aQ9DBC7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkar1aQ9DBC7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkar1aQ9DBC7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkar1aQ9DBC7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prkar1aQ9DBC7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Prkar1aQ9DBC7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkar1aQ9DBC7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms