Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg7Q9D906 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg7Q9D906 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg7Q9D906 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg7Q9D906 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg7Q9D906 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg7Q9D906 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg7Q9D906 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg7Q9D906 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg7Q9D906 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg7Q9D906 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg7Q9D906 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg7Q9D906 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg7Q9D906 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg7Q9D906 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg7Q9D906 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg7Q9D906 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg7Q9D906 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg7Q9D906 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg7Q9D906 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg7Q9D906 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg7Q9D906 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg7Q9D906 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg7Q9D906 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atg7Q9D906 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg7Q9D906 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg7Q9D906 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg7Q9D906 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg7Q9D906 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg7Q9D906 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg7Q9D906 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg7Q9D906 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg7Q9D906 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg7Q9D906 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg7Q9D906 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg7Q9D906 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg7Q9D906 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg7Q9D906 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg7Q9D906 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg7Q9D906 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg7Q9D906 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg7Q9D906 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg7Q9D906 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Atg7Q9D906 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg7Q9D906 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg7Q9D906 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg7Q9D906 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg7Q9D906 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg7Q9D906 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg7Q9D906 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg7Q9D906 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg7Q9D906 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg7Q9D906 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg7Q9D906 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg7Q9D906 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg7Q9D906 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atg7Q9D906 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atg7Q9D906 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atg7Q9D906 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atg7Q9D906 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atg7Q9D906 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atg7Q9D906 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg7Q9D906 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg7Q9D906 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg7Q9D906 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atg7Q9D906 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atg7Q9D906 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atg7Q9D906 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg7Q9D906 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms