Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gpn3Q9D3W4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gpn3Q9D3W4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gpn3Q9D3W4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gpn3Q9D3W4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpn3Q9D3W4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpn3Q9D3W4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpn3Q9D3W4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpn3Q9D3W4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpn3Q9D3W4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpn3Q9D3W4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpn3Q9D3W4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpn3Q9D3W4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpn3Q9D3W4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gpn3Q9D3W4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpn3Q9D3W4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpn3Q9D3W4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gpn3Q9D3W4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpn3Q9D3W4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpn3Q9D3W4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gpn3Q9D3W4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpn3Q9D3W4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpn3Q9D3W4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpn3Q9D3W4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gpn3Q9D3W4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpn3Q9D3W4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpn3Q9D3W4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gpn3Q9D3W4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpn3Q9D3W4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gpn3Q9D3W4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gpn3Q9D3W4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpn3Q9D3W4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpn3Q9D3W4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpn3Q9D3W4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gpn3Q9D3W4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpn3Q9D3W4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpn3Q9D3W4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpn3Q9D3W4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpn3Q9D3W4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpn3Q9D3W4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpn3Q9D3W4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gpn3Q9D3W4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpn3Q9D3W4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gpn3Q9D3W4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpn3Q9D3W4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpn3Q9D3W4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpn3Q9D3W4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpn3Q9D3W4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpn3Q9D3W4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gpn3Q9D3W4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpn3Q9D3W4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpn3Q9D3W4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gpn3Q9D3W4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpn3Q9D3W4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpn3Q9D3W4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gpn3Q9D3W4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpn3Q9D3W4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpn3Q9D3W4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpn3Q9D3W4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpn3Q9D3W4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gpn3Q9D3W4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpn3Q9D3W4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpn3Q9D3W4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpn3Q9D3W4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpn3Q9D3W4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpn3Q9D3W4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gpn3Q9D3W4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpn3Q9D3W4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpn3Q9D3W4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gpn3Q9D3W4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms