Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Y8

Mrpl52, 39S ribosomal protein L52, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl52Q9D0Y8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC14,88□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,88□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC14,88□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,88□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14,88□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,88□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14,87□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,87□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC14,87□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14,87□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,87□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,87□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,87□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,86□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,86□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,86□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC14,86□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC14,86□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,86□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14,86□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,85□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,85□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,85□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,85□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC14,85□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,85□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,85□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,85□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,85□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,84□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14,84□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,84□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,84□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,84□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,84□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14,84□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,83□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC14,83□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14,83□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,83□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14,83□□□□□ -0,03
Mrpl52Q9D0Y8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,83□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,83□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,83□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC14,82□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14,82□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14,82□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,82□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,81□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14,81□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC14,81□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,81□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,81□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14,8□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,8□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14,8□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,8□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC14,8□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,8□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14,8□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,8□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,8□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC14,79□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,79□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14,79□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,79□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,79□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,79□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,79□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,79□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC14,78□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,78□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,78□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,78□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC14,78□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14,78□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC14,78□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,78□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,78□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,78□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,78□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC14,78□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14,77□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,77□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,77□□□□□ -0,04
Mrpl52Q9D0Y8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC14,77□□□□□ -0,05
Mrpl52Q9D0Y8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14,77□□□□□ -0,05
Mrpl52Q9D0Y8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,77□□□□□ -0,05
Mrpl52Q9D0Y8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,77□□□□□ -0,05
Mrpl52Q9D0Y8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14,77□□□□□ -0,05
Mrpl52Q9D0Y8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,76□□□□□ -0,05
Mrpl52Q9D0Y8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14,76□□□□□ -0,05
Mrpl52Q9D0Y8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,76□□□□□ -0,05
Mrpl52Q9D0Y8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14,76□□□□□ -0,05
Mrpl52Q9D0Y8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,76□□□□□ -0,05
Mrpl52Q9D0Y8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,76□□□□□ -0,05
Mrpl52Q9D0Y8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC14,76□□□□□ -0,05
Mrpl52Q9D0Y8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC14,76□□□□□ -0,05
Mrpl52Q9D0Y8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,76□□□□□ -0,05
Mrpl52Q9D0Y8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,76□□□□□ -0,05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,7 ms