Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx7Q9CY18 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx7Q9CY18 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx7Q9CY18 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx7Q9CY18 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx7Q9CY18 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx7Q9CY18 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx7Q9CY18 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx7Q9CY18 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx7Q9CY18 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx7Q9CY18 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx7Q9CY18 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx7Q9CY18 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx7Q9CY18 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx7Q9CY18 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx7Q9CY18 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx7Q9CY18 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx7Q9CY18 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx7Q9CY18 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx7Q9CY18 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx7Q9CY18 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx7Q9CY18 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx7Q9CY18 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx7Q9CY18 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx7Q9CY18 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx7Q9CY18 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx7Q9CY18 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx7Q9CY18 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx7Q9CY18 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx7Q9CY18 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx7Q9CY18 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx7Q9CY18 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx7Q9CY18 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx7Q9CY18 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx7Q9CY18 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx7Q9CY18 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx7Q9CY18 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx7Q9CY18 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx7Q9CY18 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx7Q9CY18 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx7Q9CY18 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx7Q9CY18 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx7Q9CY18 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx7Q9CY18 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx7Q9CY18 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx7Q9CY18 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx7Q9CY18 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx7Q9CY18 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx7Q9CY18 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snx7Q9CY18 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx7Q9CY18 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx7Q9CY18 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx7Q9CY18 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snx7Q9CY18 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx7Q9CY18 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx7Q9CY18 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx7Q9CY18 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snx7Q9CY18 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx7Q9CY18 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx7Q9CY18 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snx7Q9CY18 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snx7Q9CY18 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx7Q9CY18 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snx7Q9CY18 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snx7Q9CY18 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx7Q9CY18 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx7Q9CY18 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx7Q9CY18 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx7Q9CY18 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx7Q9CY18 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx7Q9CY18 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snx7Q9CY18 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx7Q9CY18 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx7Q9CY18 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snx7Q9CY18 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx7Q9CY18 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx7Q9CY18 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snx7Q9CY18 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx7Q9CY18 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx7Q9CY18 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx7Q9CY18 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx7Q9CY18 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx7Q9CY18 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snx7Q9CY18 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snx7Q9CY18 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx7Q9CY18 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx7Q9CY18 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx7Q9CY18 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx7Q9CY18 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx7Q9CY18 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx7Q9CY18 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snx7Q9CY18 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx7Q9CY18 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx7Q9CY18 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx7Q9CY18 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snx7Q9CY18 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx7Q9CY18 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx7Q9CY18 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx7Q9CY18 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snx7Q9CY18 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms