Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Yif1bQ9CX30 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Yif1bQ9CX30 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Yif1bQ9CX30 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Yif1bQ9CX30 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Yif1bQ9CX30 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms