Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpusd4Q9CWX4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpusd4Q9CWX4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rpusd4Q9CWX4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms