Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,05■□□□□ -0
4930519P11RikQ9CUJ8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,05■□□□□ -0
4930519P11RikQ9CUJ8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15,05■□□□□ -0
4930519P11RikQ9CUJ8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,04■□□□□ -0
4930519P11RikQ9CUJ8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,04■□□□□ -0
4930519P11RikQ9CUJ8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15,04■□□□□ -0
4930519P11RikQ9CUJ8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,04■□□□□ -0
4930519P11RikQ9CUJ8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,04■□□□□ -0
4930519P11RikQ9CUJ8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,04■□□□□ -0
4930519P11RikQ9CUJ8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,03■□□□□ -0
4930519P11RikQ9CUJ8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,03■□□□□ -0
4930519P11RikQ9CUJ8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15,03■□□□□ -0
4930519P11RikQ9CUJ8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15,03■□□□□ -0
4930519P11RikQ9CUJ8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,03■□□□□ -0
4930519P11RikQ9CUJ8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15,03■□□□□ -0
4930519P11RikQ9CUJ8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,03■□□□□ -0
4930519P11RikQ9CUJ8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,03■□□□□ -0
4930519P11RikQ9CUJ8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15,03■□□□□ -0
4930519P11RikQ9CUJ8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15,03■□□□□ -0
4930519P11RikQ9CUJ8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,03■□□□□ -0
4930519P11RikQ9CUJ8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,03■□□□□ -0
4930519P11RikQ9CUJ8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15,03■□□□□ -0
4930519P11RikQ9CUJ8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,03■□□□□ -0
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15,02■□□□□ -0
4930519P11RikQ9CUJ8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15,02■□□□□ -0
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,02□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,02□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15,02□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,01□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15,01□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15,01□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15,01□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,99□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14,99□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,99□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC14,99□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,99□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,99□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,99□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,98□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14,98□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14,98□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,98□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,98□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC14,98□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,98□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC14,98□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,98□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14,98□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,98□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,97□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC14,97□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,97□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,97□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,97□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,97□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,97□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC14,97□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,97□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14,96□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,96□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC14,96□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC14,96□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC14,96□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,96□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,96□□□□□ -0,01
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,96□□□□□ -0,02
4930519P11RikQ9CUJ8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,95□□□□□ -0,02
4930519P11RikQ9CUJ8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC14,95□□□□□ -0,02
4930519P11RikQ9CUJ8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,95□□□□□ -0,02
4930519P11RikQ9CUJ8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,95□□□□□ -0,02
4930519P11RikQ9CUJ8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,95□□□□□ -0,02
4930519P11RikQ9CUJ8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,95□□□□□ -0,02
4930519P11RikQ9CUJ8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,94□□□□□ -0,02
4930519P11RikQ9CUJ8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,94□□□□□ -0,02
4930519P11RikQ9CUJ8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC14,94□□□□□ -0,02
4930519P11RikQ9CUJ8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14,94□□□□□ -0,02
4930519P11RikQ9CUJ8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,94□□□□□ -0,02
4930519P11RikQ9CUJ8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14,94□□□□□ -0,02
4930519P11RikQ9CUJ8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,94□□□□□ -0,02
4930519P11RikQ9CUJ8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC14,94□□□□□ -0,02
4930519P11RikQ9CUJ8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,93□□□□□ -0,02
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC14,93□□□□□ -0,02
4930519P11RikQ9CUJ8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,93□□□□□ -0,02
4930519P11RikQ9CUJ8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC14,93□□□□□ -0,02
4930519P11RikQ9CUJ8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC14,93□□□□□ -0,02
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC14,93□□□□□ -0,02
4930519P11RikQ9CUJ8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14,93□□□□□ -0,02
4930519P11RikQ9CUJ8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14,93□□□□□ -0,02
4930519P11RikQ9CUJ8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,93□□□□□ -0,02
4930519P11RikQ9CUJ8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14,93□□□□□ -0,02
4930519P11RikQ9CUJ8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,93□□□□□ -0,02
4930519P11RikQ9CUJ8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14,93□□□□□ -0,02
4930519P11RikQ9CUJ8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,93□□□□□ -0,02
4930519P11RikQ9CUJ8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,93□□□□□ -0,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29,6 ms