Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccer1Q9CQL2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccer1Q9CQL2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccer1Q9CQL2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccer1Q9CQL2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccer1Q9CQL2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccer1Q9CQL2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccer1Q9CQL2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccer1Q9CQL2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccer1Q9CQL2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccer1Q9CQL2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccer1Q9CQL2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccer1Q9CQL2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccer1Q9CQL2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccer1Q9CQL2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccer1Q9CQL2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccer1Q9CQL2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccer1Q9CQL2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccer1Q9CQL2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccer1Q9CQL2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccer1Q9CQL2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccer1Q9CQL2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccer1Q9CQL2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccer1Q9CQL2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccer1Q9CQL2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccer1Q9CQL2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccer1Q9CQL2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccer1Q9CQL2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccer1Q9CQL2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccer1Q9CQL2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccer1Q9CQL2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccer1Q9CQL2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccer1Q9CQL2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccer1Q9CQL2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccer1Q9CQL2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccer1Q9CQL2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccer1Q9CQL2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccer1Q9CQL2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccer1Q9CQL2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccer1Q9CQL2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccer1Q9CQL2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccer1Q9CQL2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccer1Q9CQL2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccer1Q9CQL2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccer1Q9CQL2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccer1Q9CQL2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccer1Q9CQL2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 350.5 ms