Protein–RNA interactions for Protein: Q99PD7

Slc24a3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc24a3Q99PD7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc24a3Q99PD7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc24a3Q99PD7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc24a3Q99PD7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms