Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sf3b1Q99NB9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sf3b1Q99NB9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sf3b1Q99NB9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sf3b1Q99NB9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf3b1Q99NB9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf3b1Q99NB9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf3b1Q99NB9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf3b1Q99NB9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sf3b1Q99NB9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b1Q99NB9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b1Q99NB9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b1Q99NB9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b1Q99NB9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sf3b1Q99NB9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3b1Q99NB9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3b1Q99NB9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sf3b1Q99NB9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3b1Q99NB9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3b1Q99NB9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sf3b1Q99NB9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Sf3b1Q99NB9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sf3b1Q99NB9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sf3b1Q99NB9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sf3b1Q99NB9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sf3b1Q99NB9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sf3b1Q99NB9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sf3b1Q99NB9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sf3b1Q99NB9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sf3b1Q99NB9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sf3b1Q99NB9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sf3b1Q99NB9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sf3b1Q99NB9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sf3b1Q99NB9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sf3b1Q99NB9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sf3b1Q99NB9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sf3b1Q99NB9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sf3b1Q99NB9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sf3b1Q99NB9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sf3b1Q99NB9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sf3b1Q99NB9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms