Protein–RNA interactions for Protein: Q99J23

Ghdc, GH3 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GhdcQ99J23 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GhdcQ99J23 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GhdcQ99J23 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GhdcQ99J23 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GhdcQ99J23 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GhdcQ99J23 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GhdcQ99J23 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GhdcQ99J23 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GhdcQ99J23 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GhdcQ99J23 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GhdcQ99J23 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GhdcQ99J23 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GhdcQ99J23 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GhdcQ99J23 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GhdcQ99J23 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GhdcQ99J23 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GhdcQ99J23 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GhdcQ99J23 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GhdcQ99J23 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GhdcQ99J23 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GhdcQ99J23 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GhdcQ99J23 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GhdcQ99J23 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GhdcQ99J23 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GhdcQ99J23 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GhdcQ99J23 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GhdcQ99J23 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GhdcQ99J23 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GhdcQ99J23 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GhdcQ99J23 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GhdcQ99J23 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GhdcQ99J23 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GhdcQ99J23 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GhdcQ99J23 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GhdcQ99J23 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GhdcQ99J23 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GhdcQ99J23 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GhdcQ99J23 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GhdcQ99J23 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GhdcQ99J23 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GhdcQ99J23 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GhdcQ99J23 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GhdcQ99J23 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GhdcQ99J23 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GhdcQ99J23 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GhdcQ99J23 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GhdcQ99J23 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GhdcQ99J23 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GhdcQ99J23 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GhdcQ99J23 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GhdcQ99J23 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GhdcQ99J23 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GhdcQ99J23 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GhdcQ99J23 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GhdcQ99J23 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GhdcQ99J23 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GhdcQ99J23 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GhdcQ99J23 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GhdcQ99J23 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GhdcQ99J23 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GhdcQ99J23 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GhdcQ99J23 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GhdcQ99J23 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GhdcQ99J23 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GhdcQ99J23 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GhdcQ99J23 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GhdcQ99J23 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GhdcQ99J23 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GhdcQ99J23 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GhdcQ99J23 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GhdcQ99J23 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GhdcQ99J23 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms