Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pde6cQ91ZQ1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pde6cQ91ZQ1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pde6cQ91ZQ1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pde6cQ91ZQ1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pde6cQ91ZQ1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pde6cQ91ZQ1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pde6cQ91ZQ1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pde6cQ91ZQ1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pde6cQ91ZQ1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pde6cQ91ZQ1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pde6cQ91ZQ1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pde6cQ91ZQ1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pde6cQ91ZQ1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pde6cQ91ZQ1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pde6cQ91ZQ1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde6cQ91ZQ1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde6cQ91ZQ1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde6cQ91ZQ1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde6cQ91ZQ1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde6cQ91ZQ1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde6cQ91ZQ1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde6cQ91ZQ1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde6cQ91ZQ1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde6cQ91ZQ1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pde6cQ91ZQ1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pde6cQ91ZQ1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde6cQ91ZQ1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde6cQ91ZQ1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde6cQ91ZQ1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde6cQ91ZQ1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pde6cQ91ZQ1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde6cQ91ZQ1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde6cQ91ZQ1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde6cQ91ZQ1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde6cQ91ZQ1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde6cQ91ZQ1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pde6cQ91ZQ1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde6cQ91ZQ1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde6cQ91ZQ1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde6cQ91ZQ1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pde6cQ91ZQ1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde6cQ91ZQ1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde6cQ91ZQ1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde6cQ91ZQ1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pde6cQ91ZQ1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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