Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1Q0

Stx19, Syntaxin-19, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx19Q8R1Q0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx19Q8R1Q0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx19Q8R1Q0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Stx19Q8R1Q0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx19Q8R1Q0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Stx19Q8R1Q0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx19Q8R1Q0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx19Q8R1Q0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Stx19Q8R1Q0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx19Q8R1Q0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx19Q8R1Q0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx19Q8R1Q0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx19Q8R1Q0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx19Q8R1Q0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx19Q8R1Q0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Stx19Q8R1Q0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx19Q8R1Q0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx19Q8R1Q0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx19Q8R1Q0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx19Q8R1Q0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx19Q8R1Q0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx19Q8R1Q0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Stx19Q8R1Q0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Stx19Q8R1Q0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx19Q8R1Q0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx19Q8R1Q0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Stx19Q8R1Q0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx19Q8R1Q0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx19Q8R1Q0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx19Q8R1Q0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx19Q8R1Q0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx19Q8R1Q0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx19Q8R1Q0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx19Q8R1Q0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Stx19Q8R1Q0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx19Q8R1Q0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Stx19Q8R1Q0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx19Q8R1Q0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx19Q8R1Q0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Stx19Q8R1Q0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx19Q8R1Q0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx19Q8R1Q0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Stx19Q8R1Q0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx19Q8R1Q0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx19Q8R1Q0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx19Q8R1Q0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx19Q8R1Q0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx19Q8R1Q0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Stx19Q8R1Q0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx19Q8R1Q0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx19Q8R1Q0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Stx19Q8R1Q0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stx19Q8R1Q0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stx19Q8R1Q0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stx19Q8R1Q0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stx19Q8R1Q0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Stx19Q8R1Q0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx19Q8R1Q0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx19Q8R1Q0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx19Q8R1Q0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx19Q8R1Q0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Stx19Q8R1Q0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx19Q8R1Q0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx19Q8R1Q0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Stx19Q8R1Q0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx19Q8R1Q0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx19Q8R1Q0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Stx19Q8R1Q0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx19Q8R1Q0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx19Q8R1Q0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx19Q8R1Q0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Stx19Q8R1Q0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx19Q8R1Q0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx19Q8R1Q0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx19Q8R1Q0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx19Q8R1Q0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx19Q8R1Q0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx19Q8R1Q0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx19Q8R1Q0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx19Q8R1Q0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx19Q8R1Q0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx19Q8R1Q0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx19Q8R1Q0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx19Q8R1Q0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx19Q8R1Q0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx19Q8R1Q0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx19Q8R1Q0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx19Q8R1Q0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx19Q8R1Q0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx19Q8R1Q0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx19Q8R1Q0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx19Q8R1Q0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx19Q8R1Q0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx19Q8R1Q0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx19Q8R1Q0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx19Q8R1Q0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx19Q8R1Q0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx19Q8R1Q0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx19Q8R1Q0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx19Q8R1Q0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms