Protein–RNA interactions for Protein: Q8K194

Snrnp27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp27Q8K194 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrnp27Q8K194 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrnp27Q8K194 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snrnp27Q8K194 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrnp27Q8K194 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrnp27Q8K194 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrnp27Q8K194 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrnp27Q8K194 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrnp27Q8K194 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrnp27Q8K194 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrnp27Q8K194 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrnp27Q8K194 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrnp27Q8K194 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrnp27Q8K194 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrnp27Q8K194 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrnp27Q8K194 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrnp27Q8K194 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrnp27Q8K194 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrnp27Q8K194 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrnp27Q8K194 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrnp27Q8K194 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrnp27Q8K194 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrnp27Q8K194 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrnp27Q8K194 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrnp27Q8K194 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snrnp27Q8K194 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snrnp27Q8K194 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snrnp27Q8K194 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snrnp27Q8K194 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snrnp27Q8K194 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snrnp27Q8K194 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snrnp27Q8K194 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snrnp27Q8K194 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snrnp27Q8K194 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrnp27Q8K194 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrnp27Q8K194 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrnp27Q8K194 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrnp27Q8K194 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrnp27Q8K194 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrnp27Q8K194 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrnp27Q8K194 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrnp27Q8K194 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrnp27Q8K194 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrnp27Q8K194 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrnp27Q8K194 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Snrnp27Q8K194 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrnp27Q8K194 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrnp27Q8K194 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrnp27Q8K194 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrnp27Q8K194 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrnp27Q8K194 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snrnp27Q8K194 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms