Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scamp1Q8K021 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scamp1Q8K021 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scamp1Q8K021 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scamp1Q8K021 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scamp1Q8K021 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Scamp1Q8K021 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scamp1Q8K021 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scamp1Q8K021 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scamp1Q8K021 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scamp1Q8K021 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Scamp1Q8K021 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scamp1Q8K021 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scamp1Q8K021 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scamp1Q8K021 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scamp1Q8K021 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scamp1Q8K021 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scamp1Q8K021 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scamp1Q8K021 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scamp1Q8K021 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scamp1Q8K021 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Scamp1Q8K021 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scamp1Q8K021 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scamp1Q8K021 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scamp1Q8K021 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scamp1Q8K021 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scamp1Q8K021 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scamp1Q8K021 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scamp1Q8K021 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scamp1Q8K021 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scamp1Q8K021 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scamp1Q8K021 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scamp1Q8K021 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scamp1Q8K021 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scamp1Q8K021 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scamp1Q8K021 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scamp1Q8K021 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scamp1Q8K021 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scamp1Q8K021 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scamp1Q8K021 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scamp1Q8K021 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scamp1Q8K021 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scamp1Q8K021 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scamp1Q8K021 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Scamp1Q8K021 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scamp1Q8K021 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scamp1Q8K021 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scamp1Q8K021 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scamp1Q8K021 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scamp1Q8K021 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scamp1Q8K021 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scamp1Q8K021 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scamp1Q8K021 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scamp1Q8K021 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scamp1Q8K021 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Scamp1Q8K021 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scamp1Q8K021 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scamp1Q8K021 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Scamp1Q8K021 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scamp1Q8K021 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scamp1Q8K021 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scamp1Q8K021 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scamp1Q8K021 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scamp1Q8K021 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Scamp1Q8K021 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms