Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD4

Gjd4, Gap junction delta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd4Q8BSD4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gjd4Q8BSD4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gjd4Q8BSD4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gjd4Q8BSD4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Gjd4Q8BSD4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gjd4Q8BSD4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Gjd4Q8BSD4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gjd4Q8BSD4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gjd4Q8BSD4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gjd4Q8BSD4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gjd4Q8BSD4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gjd4Q8BSD4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gjd4Q8BSD4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gjd4Q8BSD4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gjd4Q8BSD4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gjd4Q8BSD4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gjd4Q8BSD4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gjd4Q8BSD4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gjd4Q8BSD4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gjd4Q8BSD4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gjd4Q8BSD4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gjd4Q8BSD4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gjd4Q8BSD4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gjd4Q8BSD4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gjd4Q8BSD4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gjd4Q8BSD4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gjd4Q8BSD4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gjd4Q8BSD4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gjd4Q8BSD4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gjd4Q8BSD4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gjd4Q8BSD4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gjd4Q8BSD4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gjd4Q8BSD4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gjd4Q8BSD4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gjd4Q8BSD4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Gjd4Q8BSD4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Gjd4Q8BSD4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gjd4Q8BSD4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gjd4Q8BSD4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gjd4Q8BSD4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gjd4Q8BSD4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gjd4Q8BSD4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gjd4Q8BSD4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gjd4Q8BSD4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gjd4Q8BSD4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gjd4Q8BSD4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gjd4Q8BSD4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gjd4Q8BSD4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Gjd4Q8BSD4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gjd4Q8BSD4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Gjd4Q8BSD4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Gjd4Q8BSD4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gjd4Q8BSD4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gjd4Q8BSD4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gjd4Q8BSD4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gjd4Q8BSD4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gjd4Q8BSD4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gjd4Q8BSD4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Gjd4Q8BSD4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gjd4Q8BSD4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gjd4Q8BSD4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gjd4Q8BSD4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gjd4Q8BSD4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Gjd4Q8BSD4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gjd4Q8BSD4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gjd4Q8BSD4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gjd4Q8BSD4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gjd4Q8BSD4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gjd4Q8BSD4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Gjd4Q8BSD4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Gjd4Q8BSD4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gjd4Q8BSD4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gjd4Q8BSD4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gjd4Q8BSD4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gjd4Q8BSD4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Gjd4Q8BSD4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gjd4Q8BSD4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gjd4Q8BSD4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gjd4Q8BSD4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gjd4Q8BSD4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gjd4Q8BSD4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gjd4Q8BSD4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gjd4Q8BSD4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gjd4Q8BSD4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gjd4Q8BSD4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gjd4Q8BSD4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gjd4Q8BSD4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Gjd4Q8BSD4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gjd4Q8BSD4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Gjd4Q8BSD4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gjd4Q8BSD4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gjd4Q8BSD4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Gjd4Q8BSD4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gjd4Q8BSD4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gjd4Q8BSD4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gjd4Q8BSD4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Gjd4Q8BSD4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gjd4Q8BSD4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Gjd4Q8BSD4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gjd4Q8BSD4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms