Protein–RNA interactions for Protein: Q8BI79

Ccdc40, Coiled-coil domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc40Q8BI79 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc40Q8BI79 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc40Q8BI79 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc40Q8BI79 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc40Q8BI79 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc40Q8BI79 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc40Q8BI79 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc40Q8BI79 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc40Q8BI79 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc40Q8BI79 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc40Q8BI79 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc40Q8BI79 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc40Q8BI79 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc40Q8BI79 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc40Q8BI79 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc40Q8BI79 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc40Q8BI79 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc40Q8BI79 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc40Q8BI79 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc40Q8BI79 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc40Q8BI79 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc40Q8BI79 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc40Q8BI79 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc40Q8BI79 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc40Q8BI79 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc40Q8BI79 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc40Q8BI79 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc40Q8BI79 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc40Q8BI79 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc40Q8BI79 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc40Q8BI79 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc40Q8BI79 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc40Q8BI79 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc40Q8BI79 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc40Q8BI79 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc40Q8BI79 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc40Q8BI79 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc40Q8BI79 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc40Q8BI79 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc40Q8BI79 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc40Q8BI79 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc40Q8BI79 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms