Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Smap2Q7TN29 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smap2Q7TN29 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smap2Q7TN29 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smap2Q7TN29 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smap2Q7TN29 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smap2Q7TN29 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smap2Q7TN29 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smap2Q7TN29 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smap2Q7TN29 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smap2Q7TN29 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smap2Q7TN29 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Smap2Q7TN29 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smap2Q7TN29 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smap2Q7TN29 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smap2Q7TN29 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smap2Q7TN29 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smap2Q7TN29 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smap2Q7TN29 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smap2Q7TN29 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smap2Q7TN29 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smap2Q7TN29 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smap2Q7TN29 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smap2Q7TN29 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smap2Q7TN29 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smap2Q7TN29 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smap2Q7TN29 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smap2Q7TN29 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smap2Q7TN29 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smap2Q7TN29 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smap2Q7TN29 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Smap2Q7TN29 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smap2Q7TN29 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smap2Q7TN29 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Smap2Q7TN29 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms