Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HhipQ7TN16 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HhipQ7TN16 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HhipQ7TN16 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HhipQ7TN16 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HhipQ7TN16 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HhipQ7TN16 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HhipQ7TN16 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HhipQ7TN16 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HhipQ7TN16 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HhipQ7TN16 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HhipQ7TN16 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HhipQ7TN16 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HhipQ7TN16 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HhipQ7TN16 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HhipQ7TN16 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HhipQ7TN16 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HhipQ7TN16 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HhipQ7TN16 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HhipQ7TN16 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HhipQ7TN16 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HhipQ7TN16 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HhipQ7TN16 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HhipQ7TN16 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HhipQ7TN16 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HhipQ7TN16 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HhipQ7TN16 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HhipQ7TN16 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HhipQ7TN16 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HhipQ7TN16 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HhipQ7TN16 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HhipQ7TN16 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HhipQ7TN16 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HhipQ7TN16 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HhipQ7TN16 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HhipQ7TN16 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HhipQ7TN16 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms