Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ58

Larp1, La-related protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1Q6ZQ58 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Larp1Q6ZQ58 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Larp1Q6ZQ58 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Larp1Q6ZQ58 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Larp1Q6ZQ58 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Larp1Q6ZQ58 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Larp1Q6ZQ58 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Larp1Q6ZQ58 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Larp1Q6ZQ58 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Larp1Q6ZQ58 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Larp1Q6ZQ58 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Larp1Q6ZQ58 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Larp1Q6ZQ58 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Larp1Q6ZQ58 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Larp1Q6ZQ58 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Larp1Q6ZQ58 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Larp1Q6ZQ58 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Larp1Q6ZQ58 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Larp1Q6ZQ58 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Larp1Q6ZQ58 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Larp1Q6ZQ58 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Larp1Q6ZQ58 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Larp1Q6ZQ58 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Larp1Q6ZQ58 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Larp1Q6ZQ58 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Larp1Q6ZQ58 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Larp1Q6ZQ58 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Larp1Q6ZQ58 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Larp1Q6ZQ58 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Larp1Q6ZQ58 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Larp1Q6ZQ58 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Larp1Q6ZQ58 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Larp1Q6ZQ58 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Larp1Q6ZQ58 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Larp1Q6ZQ58 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Larp1Q6ZQ58 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Larp1Q6ZQ58 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Larp1Q6ZQ58 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Larp1Q6ZQ58 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Larp1Q6ZQ58 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Larp1Q6ZQ58 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Larp1Q6ZQ58 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Larp1Q6ZQ58 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Larp1Q6ZQ58 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Larp1Q6ZQ58 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Larp1Q6ZQ58 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Larp1Q6ZQ58 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Larp1Q6ZQ58 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Larp1Q6ZQ58 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Larp1Q6ZQ58 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Larp1Q6ZQ58 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Larp1Q6ZQ58 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Larp1Q6ZQ58 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Larp1Q6ZQ58 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Larp1Q6ZQ58 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Larp1Q6ZQ58 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Larp1Q6ZQ58 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Larp1Q6ZQ58 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Larp1Q6ZQ58 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Larp1Q6ZQ58 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Larp1Q6ZQ58 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Larp1Q6ZQ58 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Larp1Q6ZQ58 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Larp1Q6ZQ58 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Larp1Q6ZQ58 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Larp1Q6ZQ58 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Larp1Q6ZQ58 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Larp1Q6ZQ58 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Larp1Q6ZQ58 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Larp1Q6ZQ58 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Larp1Q6ZQ58 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Larp1Q6ZQ58 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Larp1Q6ZQ58 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Larp1Q6ZQ58 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Larp1Q6ZQ58 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Larp1Q6ZQ58 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Larp1Q6ZQ58 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Larp1Q6ZQ58 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Larp1Q6ZQ58 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Larp1Q6ZQ58 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Larp1Q6ZQ58 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Larp1Q6ZQ58 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Larp1Q6ZQ58 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Larp1Q6ZQ58 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Larp1Q6ZQ58 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Larp1Q6ZQ58 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Larp1Q6ZQ58 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Larp1Q6ZQ58 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Larp1Q6ZQ58 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Larp1Q6ZQ58 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Larp1Q6ZQ58 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Larp1Q6ZQ58 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Larp1Q6ZQ58 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Larp1Q6ZQ58 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Larp1Q6ZQ58 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Larp1Q6ZQ58 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Larp1Q6ZQ58 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Larp1Q6ZQ58 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Larp1Q6ZQ58 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Larp1Q6ZQ58 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms