Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NinlQ6ZQ12 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NinlQ6ZQ12 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
NinlQ6ZQ12 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC31■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC31■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NinlQ6ZQ12 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NinlQ6ZQ12 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
NinlQ6ZQ12 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NinlQ6ZQ12 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NinlQ6ZQ12 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NinlQ6ZQ12 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NinlQ6ZQ12 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NinlQ6ZQ12 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NinlQ6ZQ12 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NinlQ6ZQ12 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NinlQ6ZQ12 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NinlQ6ZQ12 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
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