Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmeff1Q6PFE7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmeff1Q6PFE7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmeff1Q6PFE7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmeff1Q6PFE7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmeff1Q6PFE7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmeff1Q6PFE7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmeff1Q6PFE7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmeff1Q6PFE7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmeff1Q6PFE7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tmeff1Q6PFE7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmeff1Q6PFE7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmeff1Q6PFE7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmeff1Q6PFE7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmeff1Q6PFE7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmeff1Q6PFE7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmeff1Q6PFE7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmeff1Q6PFE7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmeff1Q6PFE7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmeff1Q6PFE7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmeff1Q6PFE7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmeff1Q6PFE7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmeff1Q6PFE7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmeff1Q6PFE7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmeff1Q6PFE7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmeff1Q6PFE7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmeff1Q6PFE7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmeff1Q6PFE7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmeff1Q6PFE7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmeff1Q6PFE7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmeff1Q6PFE7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmeff1Q6PFE7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmeff1Q6PFE7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmeff1Q6PFE7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmeff1Q6PFE7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmeff1Q6PFE7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmeff1Q6PFE7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmeff1Q6PFE7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmeff1Q6PFE7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmeff1Q6PFE7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmeff1Q6PFE7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmeff1Q6PFE7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmeff1Q6PFE7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmeff1Q6PFE7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmeff1Q6PFE7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmeff1Q6PFE7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmeff1Q6PFE7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmeff1Q6PFE7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmeff1Q6PFE7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmeff1Q6PFE7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmeff1Q6PFE7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmeff1Q6PFE7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmeff1Q6PFE7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmeff1Q6PFE7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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