Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hmgb4Q6P8W9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hmgb4Q6P8W9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmgb4Q6P8W9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmgb4Q6P8W9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hmgb4Q6P8W9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmgb4Q6P8W9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hmgb4Q6P8W9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgb4Q6P8W9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgb4Q6P8W9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgb4Q6P8W9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgb4Q6P8W9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hmgb4Q6P8W9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hmgb4Q6P8W9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hmgb4Q6P8W9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgb4Q6P8W9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgb4Q6P8W9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgb4Q6P8W9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hmgb4Q6P8W9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hmgb4Q6P8W9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hmgb4Q6P8W9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hmgb4Q6P8W9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hmgb4Q6P8W9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgb4Q6P8W9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgb4Q6P8W9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgb4Q6P8W9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgb4Q6P8W9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hmgb4Q6P8W9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgb4Q6P8W9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgb4Q6P8W9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgb4Q6P8W9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgb4Q6P8W9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hmgb4Q6P8W9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgb4Q6P8W9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgb4Q6P8W9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgb4Q6P8W9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgb4Q6P8W9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgb4Q6P8W9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgb4Q6P8W9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hmgb4Q6P8W9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgb4Q6P8W9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgb4Q6P8W9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgb4Q6P8W9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgb4Q6P8W9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgb4Q6P8W9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hmgb4Q6P8W9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hmgb4Q6P8W9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hmgb4Q6P8W9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hmgb4Q6P8W9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hmgb4Q6P8W9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmgb4Q6P8W9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hmgb4Q6P8W9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmgb4Q6P8W9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmgb4Q6P8W9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmgb4Q6P8W9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmgb4Q6P8W9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hmgb4Q6P8W9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmgb4Q6P8W9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmgb4Q6P8W9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hmgb4Q6P8W9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmgb4Q6P8W9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmgb4Q6P8W9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hmgb4Q6P8W9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmgb4Q6P8W9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmgb4Q6P8W9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmgb4Q6P8W9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hmgb4Q6P8W9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmgb4Q6P8W9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmgb4Q6P8W9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.1 ms