Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tpd52Q62393 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tpd52Q62393 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpd52Q62393 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpd52Q62393 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpd52Q62393 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpd52Q62393 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpd52Q62393 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tpd52Q62393 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpd52Q62393 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tpd52Q62393 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpd52Q62393 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpd52Q62393 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpd52Q62393 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tpd52Q62393 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpd52Q62393 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpd52Q62393 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tpd52Q62393 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpd52Q62393 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpd52Q62393 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpd52Q62393 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tpd52Q62393 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpd52Q62393 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpd52Q62393 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tpd52Q62393 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tpd52Q62393 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tpd52Q62393 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tpd52Q62393 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tpd52Q62393 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tpd52Q62393 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tpd52Q62393 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tpd52Q62393 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tpd52Q62393 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tpd52Q62393 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tpd52Q62393 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tpd52Q62393 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpd52Q62393 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpd52Q62393 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpd52Q62393 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpd52Q62393 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpd52Q62393 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpd52Q62393 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tpd52Q62393 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpd52Q62393 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpd52Q62393 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tpd52Q62393 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpd52Q62393 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpd52Q62393 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpd52Q62393 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpd52Q62393 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpd52Q62393 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpd52Q62393 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tpd52Q62393 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpd52Q62393 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpd52Q62393 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpd52Q62393 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tpd52Q62393 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpd52Q62393 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpd52Q62393 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpd52Q62393 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tpd52Q62393 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpd52Q62393 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpd52Q62393 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpd52Q62393 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tpd52Q62393 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpd52Q62393 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpd52Q62393 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpd52Q62393 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpd52Q62393 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tpd52Q62393 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpd52Q62393 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpd52Q62393 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpd52Q62393 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpd52Q62393 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpd52Q62393 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tpd52Q62393 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpd52Q62393 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpd52Q62393 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tpd52Q62393 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpd52Q62393 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpd52Q62393 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpd52Q62393 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpd52Q62393 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpd52Q62393 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tpd52Q62393 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpd52Q62393 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpd52Q62393 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpd52Q62393 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpd52Q62393 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpd52Q62393 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tpd52Q62393 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tpd52Q62393 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tpd52Q62393 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpd52Q62393 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpd52Q62393 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpd52Q62393 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpd52Q62393 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpd52Q62393 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tpd52Q62393 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tpd52Q62393 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms