Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ss18Q62280 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ss18Q62280 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ss18Q62280 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ss18Q62280 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ss18Q62280 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ss18Q62280 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ss18Q62280 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ss18Q62280 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ss18Q62280 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ss18Q62280 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ss18Q62280 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms