Protein–RNA interactions for Protein: Q61169

Gata6, Transcription factor GATA-6, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata6Q61169 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gata6Q61169 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gata6Q61169 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gata6Q61169 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gata6Q61169 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gata6Q61169 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gata6Q61169 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gata6Q61169 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gata6Q61169 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gata6Q61169 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gata6Q61169 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gata6Q61169 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gata6Q61169 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gata6Q61169 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gata6Q61169 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gata6Q61169 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gata6Q61169 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Gata6Q61169 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gata6Q61169 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gata6Q61169 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gata6Q61169 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gata6Q61169 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gata6Q61169 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gata6Q61169 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gata6Q61169 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gata6Q61169 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gata6Q61169 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gata6Q61169 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gata6Q61169 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gata6Q61169 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gata6Q61169 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gata6Q61169 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gata6Q61169 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gata6Q61169 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gata6Q61169 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gata6Q61169 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gata6Q61169 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gata6Q61169 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gata6Q61169 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gata6Q61169 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gata6Q61169 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gata6Q61169 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gata6Q61169 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gata6Q61169 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gata6Q61169 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gata6Q61169 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gata6Q61169 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gata6Q61169 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gata6Q61169 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gata6Q61169 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gata6Q61169 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gata6Q61169 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gata6Q61169 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gata6Q61169 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gata6Q61169 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gata6Q61169 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gata6Q61169 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gata6Q61169 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gata6Q61169 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gata6Q61169 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gata6Q61169 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gata6Q61169 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gata6Q61169 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gata6Q61169 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gata6Q61169 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gata6Q61169 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gata6Q61169 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gata6Q61169 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gata6Q61169 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gata6Q61169 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gata6Q61169 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gata6Q61169 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gata6Q61169 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gata6Q61169 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gata6Q61169 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gata6Q61169 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gata6Q61169 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gata6Q61169 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gata6Q61169 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gata6Q61169 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gata6Q61169 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gata6Q61169 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gata6Q61169 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gata6Q61169 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gata6Q61169 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gata6Q61169 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gata6Q61169 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gata6Q61169 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gata6Q61169 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gata6Q61169 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gata6Q61169 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gata6Q61169 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gata6Q61169 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gata6Q61169 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gata6Q61169 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gata6Q61169 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gata6Q61169 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gata6Q61169 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gata6Q61169 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gata6Q61169 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms