Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Satb1Q60611 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Satb1Q60611 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Satb1Q60611 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Satb1Q60611 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Satb1Q60611 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Satb1Q60611 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Satb1Q60611 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Satb1Q60611 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Satb1Q60611 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Satb1Q60611 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Satb1Q60611 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Satb1Q60611 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Satb1Q60611 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Satb1Q60611 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Satb1Q60611 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Satb1Q60611 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Satb1Q60611 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Satb1Q60611 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Satb1Q60611 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Satb1Q60611 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Satb1Q60611 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Satb1Q60611 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Satb1Q60611 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Satb1Q60611 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Satb1Q60611 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Satb1Q60611 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Satb1Q60611 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Satb1Q60611 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Satb1Q60611 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Satb1Q60611 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Satb1Q60611 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Satb1Q60611 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms