Protein–RNA interactions for Protein: Q5QNQ9

Col27a1, Collagen alpha-1(XXVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col27a1Q5QNQ9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col27a1Q5QNQ9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col27a1Q5QNQ9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col27a1Q5QNQ9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col27a1Q5QNQ9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col27a1Q5QNQ9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col27a1Q5QNQ9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col27a1Q5QNQ9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col27a1Q5QNQ9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col27a1Q5QNQ9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col27a1Q5QNQ9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col27a1Q5QNQ9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col27a1Q5QNQ9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col27a1Q5QNQ9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col27a1Q5QNQ9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Col27a1Q5QNQ9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col27a1Q5QNQ9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col27a1Q5QNQ9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col27a1Q5QNQ9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col27a1Q5QNQ9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col27a1Q5QNQ9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col27a1Q5QNQ9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col27a1Q5QNQ9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col27a1Q5QNQ9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col27a1Q5QNQ9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col27a1Q5QNQ9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col27a1Q5QNQ9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Col27a1Q5QNQ9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col27a1Q5QNQ9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col27a1Q5QNQ9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col27a1Q5QNQ9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col27a1Q5QNQ9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Col27a1Q5QNQ9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col27a1Q5QNQ9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col27a1Q5QNQ9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col27a1Q5QNQ9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col27a1Q5QNQ9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col27a1Q5QNQ9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col27a1Q5QNQ9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col27a1Q5QNQ9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col27a1Q5QNQ9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col27a1Q5QNQ9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col27a1Q5QNQ9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Col27a1Q5QNQ9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col27a1Q5QNQ9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col27a1Q5QNQ9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col27a1Q5QNQ9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col27a1Q5QNQ9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col27a1Q5QNQ9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col27a1Q5QNQ9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col27a1Q5QNQ9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col27a1Q5QNQ9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col27a1Q5QNQ9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col27a1Q5QNQ9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col27a1Q5QNQ9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col27a1Q5QNQ9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col27a1Q5QNQ9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col27a1Q5QNQ9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col27a1Q5QNQ9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col27a1Q5QNQ9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col27a1Q5QNQ9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col27a1Q5QNQ9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col27a1Q5QNQ9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col27a1Q5QNQ9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col27a1Q5QNQ9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col27a1Q5QNQ9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Col27a1Q5QNQ9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col27a1Q5QNQ9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col27a1Q5QNQ9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col27a1Q5QNQ9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Col27a1Q5QNQ9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col27a1Q5QNQ9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms