Protein–RNA interactions for Protein: Q3V096

Ankrd42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd42Q3V096 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd42Q3V096 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd42Q3V096 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd42Q3V096 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd42Q3V096 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd42Q3V096 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd42Q3V096 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd42Q3V096 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd42Q3V096 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd42Q3V096 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd42Q3V096 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd42Q3V096 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd42Q3V096 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd42Q3V096 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd42Q3V096 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd42Q3V096 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd42Q3V096 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd42Q3V096 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd42Q3V096 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd42Q3V096 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd42Q3V096 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd42Q3V096 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd42Q3V096 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd42Q3V096 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd42Q3V096 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd42Q3V096 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd42Q3V096 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ankrd42Q3V096 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ankrd42Q3V096 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms