Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prom2Q3UUY6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prom2Q3UUY6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prom2Q3UUY6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Prom2Q3UUY6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prom2Q3UUY6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prom2Q3UUY6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prom2Q3UUY6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prom2Q3UUY6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prom2Q3UUY6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prom2Q3UUY6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Prom2Q3UUY6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prom2Q3UUY6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prom2Q3UUY6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prom2Q3UUY6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prom2Q3UUY6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prom2Q3UUY6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prom2Q3UUY6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prom2Q3UUY6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prom2Q3UUY6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prom2Q3UUY6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prom2Q3UUY6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prom2Q3UUY6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prom2Q3UUY6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Prom2Q3UUY6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prom2Q3UUY6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prom2Q3UUY6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Prom2Q3UUY6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prom2Q3UUY6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prom2Q3UUY6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prom2Q3UUY6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prom2Q3UUY6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Prom2Q3UUY6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prom2Q3UUY6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prom2Q3UUY6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prom2Q3UUY6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prom2Q3UUY6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prom2Q3UUY6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Prom2Q3UUY6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Prom2Q3UUY6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Prom2Q3UUY6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prom2Q3UUY6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prom2Q3UUY6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prom2Q3UUY6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prom2Q3UUY6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prom2Q3UUY6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Prom2Q3UUY6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prom2Q3UUY6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prom2Q3UUY6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prom2Q3UUY6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prom2Q3UUY6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prom2Q3UUY6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prom2Q3UUY6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prom2Q3UUY6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prom2Q3UUY6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prom2Q3UUY6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prom2Q3UUY6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prom2Q3UUY6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prom2Q3UUY6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prom2Q3UUY6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prom2Q3UUY6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prom2Q3UUY6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prom2Q3UUY6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prom2Q3UUY6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Prom2Q3UUY6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prom2Q3UUY6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prom2Q3UUY6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prom2Q3UUY6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Prom2Q3UUY6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prom2Q3UUY6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prom2Q3UUY6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Prom2Q3UUY6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prom2Q3UUY6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prom2Q3UUY6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prom2Q3UUY6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prom2Q3UUY6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prom2Q3UUY6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prom2Q3UUY6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Prom2Q3UUY6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prom2Q3UUY6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Prom2Q3UUY6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prom2Q3UUY6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Prom2Q3UUY6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prom2Q3UUY6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Prom2Q3UUY6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Prom2Q3UUY6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prom2Q3UUY6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prom2Q3UUY6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prom2Q3UUY6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prom2Q3UUY6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prom2Q3UUY6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prom2Q3UUY6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prom2Q3UUY6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prom2Q3UUY6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prom2Q3UUY6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prom2Q3UUY6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prom2Q3UUY6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prom2Q3UUY6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prom2Q3UUY6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prom2Q3UUY6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms