Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm20Q3UQS8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm20Q3UQS8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm20Q3UQS8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm20Q3UQS8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm20Q3UQS8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm20Q3UQS8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rbm20Q3UQS8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbm20Q3UQS8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbm20Q3UQS8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rbm20Q3UQS8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm20Q3UQS8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm20Q3UQS8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm20Q3UQS8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rbm20Q3UQS8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbm20Q3UQS8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbm20Q3UQS8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rbm20Q3UQS8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm20Q3UQS8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm20Q3UQS8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm20Q3UQS8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm20Q3UQS8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rbm20Q3UQS8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbm20Q3UQS8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbm20Q3UQS8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rbm20Q3UQS8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm20Q3UQS8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm20Q3UQS8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rbm20Q3UQS8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rbm20Q3UQS8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rbm20Q3UQS8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbm20Q3UQS8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbm20Q3UQS8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbm20Q3UQS8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbm20Q3UQS8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbm20Q3UQS8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbm20Q3UQS8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rbm20Q3UQS8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbm20Q3UQS8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbm20Q3UQS8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbm20Q3UQS8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbm20Q3UQS8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbm20Q3UQS8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbm20Q3UQS8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rbm20Q3UQS8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbm20Q3UQS8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbm20Q3UQS8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbm20Q3UQS8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rbm20Q3UQS8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm20Q3UQS8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm20Q3UQS8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rbm20Q3UQS8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbm20Q3UQS8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbm20Q3UQS8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbm20Q3UQS8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rbm20Q3UQS8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbm20Q3UQS8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbm20Q3UQS8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbm20Q3UQS8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbm20Q3UQS8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rbm20Q3UQS8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbm20Q3UQS8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbm20Q3UQS8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rbm20Q3UQS8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbm20Q3UQS8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbm20Q3UQS8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbm20Q3UQS8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rbm20Q3UQS8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbm20Q3UQS8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbm20Q3UQS8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbm20Q3UQS8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rbm20Q3UQS8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rbm20Q3UQS8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rbm20Q3UQS8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbm20Q3UQS8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbm20Q3UQS8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rbm20Q3UQS8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rbm20Q3UQS8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rbm20Q3UQS8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rbm20Q3UQS8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rbm20Q3UQS8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rbm20Q3UQS8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rbm20Q3UQS8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbm20Q3UQS8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbm20Q3UQS8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbm20Q3UQS8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbm20Q3UQS8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rbm20Q3UQS8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rbm20Q3UQS8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rbm20Q3UQS8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbm20Q3UQS8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbm20Q3UQS8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rbm20Q3UQS8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbm20Q3UQS8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rbm20Q3UQS8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rbm20Q3UQS8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rbm20Q3UQS8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbm20Q3UQS8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbm20Q3UQS8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rbm20Q3UQS8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
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