Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Washc4Q3UMB9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Washc4Q3UMB9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Washc4Q3UMB9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Washc4Q3UMB9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Washc4Q3UMB9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Washc4Q3UMB9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Washc4Q3UMB9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Washc4Q3UMB9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Washc4Q3UMB9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Washc4Q3UMB9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Washc4Q3UMB9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Washc4Q3UMB9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Washc4Q3UMB9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Washc4Q3UMB9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Washc4Q3UMB9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Washc4Q3UMB9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Washc4Q3UMB9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Washc4Q3UMB9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Washc4Q3UMB9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Washc4Q3UMB9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Washc4Q3UMB9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Washc4Q3UMB9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Washc4Q3UMB9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Washc4Q3UMB9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Washc4Q3UMB9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Washc4Q3UMB9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Washc4Q3UMB9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Washc4Q3UMB9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Washc4Q3UMB9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Washc4Q3UMB9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Washc4Q3UMB9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Washc4Q3UMB9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Washc4Q3UMB9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Washc4Q3UMB9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Washc4Q3UMB9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Washc4Q3UMB9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Washc4Q3UMB9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Washc4Q3UMB9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Washc4Q3UMB9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Washc4Q3UMB9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Washc4Q3UMB9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Washc4Q3UMB9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Washc4Q3UMB9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Washc4Q3UMB9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Washc4Q3UMB9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Washc4Q3UMB9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Washc4Q3UMB9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Washc4Q3UMB9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Washc4Q3UMB9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Washc4Q3UMB9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Washc4Q3UMB9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Washc4Q3UMB9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Washc4Q3UMB9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Washc4Q3UMB9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Washc4Q3UMB9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Washc4Q3UMB9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Washc4Q3UMB9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Washc4Q3UMB9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Washc4Q3UMB9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Washc4Q3UMB9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Washc4Q3UMB9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Washc4Q3UMB9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Washc4Q3UMB9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Washc4Q3UMB9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Washc4Q3UMB9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Washc4Q3UMB9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Washc4Q3UMB9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Washc4Q3UMB9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Washc4Q3UMB9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Washc4Q3UMB9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Washc4Q3UMB9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms