Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

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Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm4dQ3U2K5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm4dQ3U2K5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm4dQ3U2K5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm4dQ3U2K5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm4dQ3U2K5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm4dQ3U2K5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm4dQ3U2K5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm4dQ3U2K5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm4dQ3U2K5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm4dQ3U2K5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm4dQ3U2K5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kdm4dQ3U2K5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Kdm4dQ3U2K5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm4dQ3U2K5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kdm4dQ3U2K5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm4dQ3U2K5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm4dQ3U2K5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm4dQ3U2K5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kdm4dQ3U2K5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm4dQ3U2K5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kdm4dQ3U2K5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm4dQ3U2K5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kdm4dQ3U2K5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm4dQ3U2K5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm4dQ3U2K5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm4dQ3U2K5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm4dQ3U2K5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kdm4dQ3U2K5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kdm4dQ3U2K5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kdm4dQ3U2K5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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