Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdgfl1Q2VPR5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdgfl1Q2VPR5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdgfl1Q2VPR5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdgfl1Q2VPR5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdgfl1Q2VPR5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdgfl1Q2VPR5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdgfl1Q2VPR5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdgfl1Q2VPR5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdgfl1Q2VPR5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdgfl1Q2VPR5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdgfl1Q2VPR5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hdgfl1Q2VPR5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdgfl1Q2VPR5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdgfl1Q2VPR5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdgfl1Q2VPR5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdgfl1Q2VPR5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdgfl1Q2VPR5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hdgfl1Q2VPR5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hdgfl1Q2VPR5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hdgfl1Q2VPR5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms