Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF94

Nkpd1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkpd1Q0VF94 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nkpd1Q0VF94 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nkpd1Q0VF94 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nkpd1Q0VF94 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkpd1Q0VF94 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkpd1Q0VF94 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkpd1Q0VF94 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkpd1Q0VF94 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkpd1Q0VF94 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nkpd1Q0VF94 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkpd1Q0VF94 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkpd1Q0VF94 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkpd1Q0VF94 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nkpd1Q0VF94 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkpd1Q0VF94 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkpd1Q0VF94 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkpd1Q0VF94 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkpd1Q0VF94 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nkpd1Q0VF94 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkpd1Q0VF94 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkpd1Q0VF94 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkpd1Q0VF94 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkpd1Q0VF94 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nkpd1Q0VF94 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkpd1Q0VF94 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkpd1Q0VF94 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkpd1Q0VF94 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkpd1Q0VF94 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nkpd1Q0VF94 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nkpd1Q0VF94 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nkpd1Q0VF94 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nkpd1Q0VF94 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms