Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
F13bQ07968 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
F13bQ07968 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
F13bQ07968 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
F13bQ07968 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
F13bQ07968 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
F13bQ07968 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
F13bQ07968 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
F13bQ07968 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
F13bQ07968 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
F13bQ07968 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
F13bQ07968 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
F13bQ07968 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
F13bQ07968 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
F13bQ07968 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
F13bQ07968 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
F13bQ07968 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
F13bQ07968 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
F13bQ07968 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
F13bQ07968 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
F13bQ07968 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
F13bQ07968 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
F13bQ07968 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F13bQ07968 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F13bQ07968 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms