Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sox12Q04890 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sox12Q04890 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sox12Q04890 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Sox12Q04890 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Sox12Q04890 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Sox12Q04890 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Sox12Q04890 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Sox12Q04890 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Sox12Q04890 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Sox12Q04890 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Sox12Q04890 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Sox12Q04890 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Sox12Q04890 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Sox12Q04890 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Sox12Q04890 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Sox12Q04890 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Sox12Q04890 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Sox12Q04890 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Sox12Q04890 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Sox12Q04890 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Sox12Q04890 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Sox12Q04890 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Sox12Q04890 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Sox12Q04890 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Sox12Q04890 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Sox12Q04890 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Sox12Q04890 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Sox12Q04890 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Sox12Q04890 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Sox12Q04890 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Sox12Q04890 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Sox12Q04890 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Sox12Q04890 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Sox12Q04890 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Sox12Q04890 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Sox12Q04890 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Sox12Q04890 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Sox12Q04890 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Sox12Q04890 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Sox12Q04890 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sox12Q04890 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sox12Q04890 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sox12Q04890 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sox12Q04890 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sox12Q04890 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Sox12Q04890 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sox12Q04890 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sox12Q04890 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sox12Q04890 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sox12Q04890 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sox12Q04890 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sox12Q04890 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sox12Q04890 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sox12Q04890 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Sox12Q04890 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Sox12Q04890 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Sox12Q04890 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Sox12Q04890 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Sox12Q04890 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Sox12Q04890 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Sox12Q04890 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Sox12Q04890 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Sox12Q04890 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Sox12Q04890 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Sox12Q04890 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Sox12Q04890 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Sox12Q04890 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Sox12Q04890 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Sox12Q04890 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Sox12Q04890 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Sox12Q04890 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Sox12Q04890 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Sox12Q04890 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Sox12Q04890 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Sox12Q04890 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Sox12Q04890 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Sox12Q04890 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Sox12Q04890 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Sox12Q04890 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Sox12Q04890 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Sox12Q04890 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Sox12Q04890 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Sox12Q04890 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Sox12Q04890 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Sox12Q04890 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Sox12Q04890 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Sox12Q04890 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Sox12Q04890 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Sox12Q04890 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Sox12Q04890 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Sox12Q04890 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Sox12Q04890 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Sox12Q04890 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Sox12Q04890 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Sox12Q04890 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Sox12Q04890 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Sox12Q04890 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Sox12Q04890 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Sox12Q04890 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms