Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Csrnp1P59054 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Csrnp1P59054 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Csrnp1P59054 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Csrnp1P59054 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Csrnp1P59054 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Csrnp1P59054 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Csrnp1P59054 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Csrnp1P59054 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Csrnp1P59054 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Csrnp1P59054 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Csrnp1P59054 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Csrnp1P59054 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Csrnp1P59054 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Csrnp1P59054 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Csrnp1P59054 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Csrnp1P59054 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Csrnp1P59054 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Csrnp1P59054 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Csrnp1P59054 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Csrnp1P59054 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Csrnp1P59054 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Csrnp1P59054 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Csrnp1P59054 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Csrnp1P59054 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Csrnp1P59054 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Csrnp1P59054 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Csrnp1P59054 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Csrnp1P59054 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Csrnp1P59054 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Csrnp1P59054 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Csrnp1P59054 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Csrnp1P59054 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Csrnp1P59054 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Csrnp1P59054 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Csrnp1P59054 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Csrnp1P59054 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Csrnp1P59054 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Csrnp1P59054 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Csrnp1P59054 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Csrnp1P59054 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Csrnp1P59054 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Csrnp1P59054 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Csrnp1P59054 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Csrnp1P59054 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Csrnp1P59054 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Csrnp1P59054 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Csrnp1P59054 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Csrnp1P59054 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Csrnp1P59054 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Csrnp1P59054 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Csrnp1P59054 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Csrnp1P59054 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Csrnp1P59054 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Csrnp1P59054 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Csrnp1P59054 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Csrnp1P59054 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Csrnp1P59054 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Csrnp1P59054 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Csrnp1P59054 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Csrnp1P59054 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Csrnp1P59054 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Csrnp1P59054 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Csrnp1P59054 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Csrnp1P59054 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Csrnp1P59054 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Csrnp1P59054 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Csrnp1P59054 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Csrnp1P59054 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Csrnp1P59054 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Csrnp1P59054 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Csrnp1P59054 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Csrnp1P59054 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Csrnp1P59054 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Csrnp1P59054 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Csrnp1P59054 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Csrnp1P59054 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Csrnp1P59054 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Csrnp1P59054 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Csrnp1P59054 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Csrnp1P59054 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Csrnp1P59054 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Csrnp1P59054 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Csrnp1P59054 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Csrnp1P59054 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Csrnp1P59054 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Csrnp1P59054 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Csrnp1P59054 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Csrnp1P59054 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Csrnp1P59054 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Csrnp1P59054 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Csrnp1P59054 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Csrnp1P59054 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Csrnp1P59054 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Csrnp1P59054 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Csrnp1P59054 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Csrnp1P59054 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Csrnp1P59054 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Csrnp1P59054 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Csrnp1P59054 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms