Protein–RNA interactions for Protein: P54818

Galc, Galactocerebrosidase, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GalcP54818 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GalcP54818 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GalcP54818 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GalcP54818 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
GalcP54818 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GalcP54818 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GalcP54818 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GalcP54818 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GalcP54818 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GalcP54818 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GalcP54818 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GalcP54818 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GalcP54818 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GalcP54818 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
GalcP54818 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
GalcP54818 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GalcP54818 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GalcP54818 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GalcP54818 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GalcP54818 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GalcP54818 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GalcP54818 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GalcP54818 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GalcP54818 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GalcP54818 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GalcP54818 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GalcP54818 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GalcP54818 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GalcP54818 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GalcP54818 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GalcP54818 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GalcP54818 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GalcP54818 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GalcP54818 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GalcP54818 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GalcP54818 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GalcP54818 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GalcP54818 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GalcP54818 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GalcP54818 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GalcP54818 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GalcP54818 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GalcP54818 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GalcP54818 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GalcP54818 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GalcP54818 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GalcP54818 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GalcP54818 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GalcP54818 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GalcP54818 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GalcP54818 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GalcP54818 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GalcP54818 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GalcP54818 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GalcP54818 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GalcP54818 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GalcP54818 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GalcP54818 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GalcP54818 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GalcP54818 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GalcP54818 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GalcP54818 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GalcP54818 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GalcP54818 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GalcP54818 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GalcP54818 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GalcP54818 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GalcP54818 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GalcP54818 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GalcP54818 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GalcP54818 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GalcP54818 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GalcP54818 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GalcP54818 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GalcP54818 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GalcP54818 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GalcP54818 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GalcP54818 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GalcP54818 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GalcP54818 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
GalcP54818 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GalcP54818 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GalcP54818 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GalcP54818 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
GalcP54818 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GalcP54818 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
GalcP54818 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GalcP54818 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GalcP54818 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GalcP54818 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GalcP54818 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GalcP54818 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GalcP54818 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GalcP54818 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GalcP54818 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GalcP54818 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
GalcP54818 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GalcP54818 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GalcP54818 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GalcP54818 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms